為了應對日新月異的高科技犯罪，獨立于司法和警察系統之外的第三方機構特殊科學搜查研究所（SRI）宣布成eee。在所長的矢千景（原田美枝子飾）的主持下，牧史郎（上川隆也飾）、三澤京助（原田泰造飾）、小川紗織（高橋真唯飾）、野村洋（村井良大飾）等四名成員一次次奔赴各種離奇詭異的犯罪現場。《血球》森林中驚現全身脫水的干尸，死者生前曾被血球追殺；《伏地女王》一男子被突然出現的螞蟻咬成白骨，這一切似乎與某個全女性組成的生化公司有關；《在黑暗中蠢蠢欲動的美少女》多年前死去的七歲童星，突然出現在夜晚的街頭，她一邊唱歌一邊將靠近她的人化作液體；《窺視深淵之人》接連數起設計巧妙的高智商高科技犯罪，矛頭卻直指牧史郎。